Sim, basta acessar a [R33 - Parâmetros por Estabelecimento], e configurar o parâmetro [P1049 - Seguradora padrão na R200 - Emissão de CT-e] , conforme imagem abaixo:
Feito isso, é só acessa a [R200 - Emissão de CT-e] e iniciar um novo CTe, e então virá a seguradora conforme parametrizado anteriormente: