Verifique na rotina [R355 - Fórmulas de Cálculo] se a fórmula de custo personalizável está devidamente configurada.
Verifique na rotina [R29 - Parâmetros por Empresa] qual o valor configurado para o parâmetro [P543 - Modificar nome do custo personalizável?], logo execute na rotina [R577 - Regrava Custos da NF de Saída] a atualização da informação de custo personalizável da notas já existentes.