Muito simples;
Essa funcionalidade está disponível exclusivamente se a empresa não está com o parâmetro por estabelecimento [493 Realiza validação de código de barras?] configurado e ativo.
Caso esteja ativo e com valor, verificar se os demais ESTABELECIMENTOS realmente precisam deste parâmetro, se não precisarem basta desfazer a parametrização e recarregar a rotina que as opções irão aparecer.