É possível, desde que não exista troca de títulos e com portadores diferentes.
O relatório [R231 - Notas Fiscais Emitidas] têm as Notas Fiscais emitidas como base para "montar" o resumo por portador. Com isso, ele analisa o título gerado originalmente na venda.
Exemplo:
No exemplo acima o título originalmente pertence ao portador "CABAL DEBITO", portando no R231 será contabilizado para este portador no Resumo por Portadores.
Já o relatório [97 - Títulos Emitidos] têm os títulos emitidos como base para "montar" o resumo por portador. Ele analisa o título conforme ele está atualmente, portanto o valor do exemplo acima será contabilizado no portador "VISA DEBITO".
Obs: Caso o título seja trocado, mas o portador se mantenha no mesmo, o resumo por portadores deve coincidir entre os relatórios.