Sim é possível, se um item por estabelecimento na rotina [R135- Itens Por estabelecimento ] estiver configurado com a alíquota de saída 0%
E o parâmetro por estabelecimento [código: 317 nome: ALIQUOTAVALIDACAOEMISSAONFSE] estiver ativo e configurado com valor 0 na [R33 - Parâmetros por Estabelecimento]:
Ao utilizar este item na [R419 - Vendas no Varejo] será permitido a utilização da alíquota de iss com valor 0.