Sim, pode receber o boleto, no entanto deverá se atentar a alguns detalhes:
1 - Existe um direito na rotina 657 "Permite receber boleto vinculado em remessa" caso o usuário que está efetuando a remessa não possua o direito o sistema não permitirá a baixa.
2 - Ainda que o Usuário não possua o direito acima, ele poderá receber esse título se acessar a rotina 249, ir no direito exibir e em dados adicionais, deletar a remessa do titulo através do botão "del".
OBS: Para ambas as opções mencionadas acima é necessário que se de baixa do boleto no banco, pois caso isso não seja feito o boleto continuará no banco podendo o cliente inclusive ser protestado indevidamente.