Sim, é possível.
Segue o passo-a-passo de como realizar a configuração.
1º - Deverá inicialmente acessar a rotina 29 (Parâmetros por Empresa) e ativar o parâmetro 699.
2º - Acessar a rotina R281, informar o evento contábil que irá utilizar no lançamento, depois clique em ALTERAR ir na aba Contas Contábeis e verifique qual o número da conta que deve irá sofrer alteração na R32.
3º - Na R32, pesquisa pela conta e clique em ALTERAR, desmarcar a flag Pede Centro de custo.
Selecione a opção Por Estabelecimento/Centro de Custo.
Os: As etapas 2 e 3 deverá ser feita para cada evento contábil que deseja que tenha o rateio.