É permitido editar um CT-e após a importação do xml, basta selecionar o CT-e que não foi transmitido, e clicar em alterar na tela principal da [R200 - Emissão de CT-e] e clicar no botão alterar:
Na próxima tela, basta clicar em próximo, sem a necessidade de informar outro arquivo xml:
Então os dados estarão disponíveis para edição nas próximas telas:
Após aterar os dados, basta seguir o fluxo e clicar em salvar.